35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1815 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  40.54 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  38.61 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  38.74 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  39.13 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  39.29 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  38 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  33.04 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  36.54 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  34.78 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  33.91 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  32.46 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  31.9 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  32.05 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  33.91 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  30.39 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  29.73 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  36.49 
 
 		 139 aa  47.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  34.09 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  32.53 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  32.29 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  32.29 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  32.46 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  32.29 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  32.14 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  30.7 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  30.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  30.53 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  31.82 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  28.26 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>