13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2554 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  56.69 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  57.14 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  43.68 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  31.68 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  38.54 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  34.09 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  29.51 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  50 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  32.41 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  31.68 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  27.73 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>