18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1747 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  256  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  67.21 
 
 
124 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  57.14 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  43.64 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  33.04 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  32.26 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  33.88 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  30.28 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  33.06 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  45.1 
 
 
305 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  45.1 
 
 
305 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  45.1 
 
 
311 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  32.82 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  40 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  45.65 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>