25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1813 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  36.21 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  38.61 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  32.43 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  33.33 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  27.87 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  30.39 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  27.97 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  28.85 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  29.46 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  28.83 
 
 
135 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  31.07 
 
 
146 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  30.43 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  28.44 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  30.68 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  23.93 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  31.08 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  25.45 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  22.94 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  24.78 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  24.42 
 
 
145 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>