56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3157 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  53.08 
 
 
147 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  53.85 
 
 
147 aa  153  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  52.99 
 
 
145 aa  152  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  51.82 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  48.51 
 
 
145 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  47.76 
 
 
139 aa  140  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  47.14 
 
 
152 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  47.33 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  46.21 
 
 
142 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  48.41 
 
 
148 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  42.31 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  41.09 
 
 
133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  42.52 
 
 
131 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  36.64 
 
 
132 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  34.65 
 
 
130 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  33.07 
 
 
130 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  36.29 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  37.4 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  33.87 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  32.28 
 
 
140 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  29.63 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  31.2 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  31.01 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  37.6 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  32.59 
 
 
305 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  30.37 
 
 
305 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  30.37 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  29.59 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  29.9 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  21.93 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  28.79 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  30.99 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  29.11 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  31.18 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  24.78 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  32.5 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  27.47 
 
 
119 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  32.1 
 
 
116 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  26.25 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  29.87 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  24.1 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  28.99 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  24.75 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  24.14 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  33.71 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>