78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1418 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 145 aa  296  7e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  67.94 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  64.62 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  51.94 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  53.54 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  51.18 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  49.6 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  48.82 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  45.67 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  42.28 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  45.9 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  44.8 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  43.44 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  44.53 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  45.6 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  40.16 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  39.34 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  37.4 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  36.72 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  31.5 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  35.77 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  34.04 
 
 		 145 aa  85.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  33.86 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  32.61 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  36.69 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  34.78 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  28.24 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  36.54 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  35.11 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  35.11 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  38.95 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  32.43 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  36.46 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  39.51 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  32.63 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  29.41 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  31.03 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  32.1 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  27.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  38.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  38.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  30.99 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  33.72 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  34.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  33.87 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  30.11 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  34.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  32.22 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  30.53 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  25.61 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  35.09 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  30 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  29.87 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  30.77 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  26.09 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  29.73 
 
 		 117 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  29.17 
 
 		 113 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  32.39 
 
 		 119 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  30.38 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  29.03 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  31.65 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  29.89 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  36.71 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  34.55 
 
 		 143 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>