15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2306 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 143 aa  297  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3263  GPW/gp25 family protein  35.92 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3592  GPW/gp25 family protein  31.21 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4108  GPW/gp25 family protein  32.17 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0172593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4870  GPW/gp25 family protein  30.28 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0638168  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  27.27 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  37.18 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  33.72 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  33.87 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  26.32 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  30.34 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  36.11 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  36.67 
 
 		 140 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>