64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1050 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  71.54 
 
 		 139 aa  196  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  64.62 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  48.84 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  50.39 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 		 165 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  48 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  47.24 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  46.15 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  44.19 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  46.46 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  44.96 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  39.02 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  39.53 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  39.55 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  43.09 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  39.84 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  36.59 
 
 		 131 aa  95.9  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  38.58 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  31.75 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  30.83 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  32.28 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  33.06 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  44.44 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  33.86 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  31.25 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  31.39 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  32.52 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  28.57 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 		 311 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  32.56 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  32.56 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  37.89 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  24.82 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  41.18 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  31.07 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  27.87 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  29.63 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  37.31 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  31.13 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  31.18 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  31.87 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  31.87 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  36.25 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  32.84 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  41.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  39.62 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  36.25 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  33.9 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  32.84 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  36.67 
 
 		 143 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  31.4 
 
 		 114 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  32.14 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  42.67 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  41.51 
 
 		 165 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>