88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1622 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  100 
 
 		 109 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  51.89 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  51.89 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  54.72 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  47.71 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  52.29 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  49.5 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  49.53 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  51.4 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  51.58 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  51.4 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  52.34 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  48.6 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  48.6 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  45.54 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  48.81 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  44.95 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  44.95 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  44.95 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  44.95 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  48.6 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  48.94 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  50.63 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  46.73 
 
 		 108 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  40.59 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  44.76 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  49.44 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  47.66 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  47.37 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  53.16 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  40.95 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  45.74 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  45.71 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  45.74 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  45.74 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  45.83 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  45.74 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  48.72 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  44.09 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  48.96 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  44.76 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  41.75 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  44.44 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  48.57 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  37.23 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  36.54 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  44.12 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  45.33 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  41.77 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  45.33 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  44 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  36.54 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  41.12 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  41.56 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  37.65 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0684  hypothetical protein  31.68 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  38.36 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  35.92 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  36.99 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  29.41 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  37.31 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  38.46 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  38.46 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  36.23 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.14 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  41.03 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  28.21 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  39.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  39.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  39.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  29.11 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  32.47 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  33.82 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  32.18 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  36.92 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  35.23 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  33.75 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  33.72 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>