72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1865 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 111 aa  219  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  56.48 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  53.27 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  54.21 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  51.4 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  54.21 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  50.47 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  46.24 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  48.19 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  39.25 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  40 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  40 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  41.12 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  42.57 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  39.56 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  41.9 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  41.9 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  36.45 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  39.42 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  37.5 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  35.14 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  35.51 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  39.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  48.68 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  48.68 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  36.27 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  35.29 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  35.14 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  40.59 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  39.36 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  35.29 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  42 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  36.79 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  44.3 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  39 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  36.45 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  44.16 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  36.11 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  44.59 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  44.59 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  34.86 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  37.36 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  37.36 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  32.38 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  36.36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  39.51 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  41.89 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  41.3 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  37.97 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  40 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  31.78 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  35.87 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  35.87 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  35.87 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  42.03 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  34.57 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  26.67 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  37.35 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01989  hypothetical protein  27.1 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  32.65 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  28.41 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  34.74 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  34.09 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  34.48 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  36.71 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  33.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  35.29 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  28.89 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>