67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3821 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  65.52 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  51.49 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  51.58 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  44.74 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  51.58 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  50.53 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  46.96 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  50.53 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  50.53 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  43.48 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  49.47 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  47.42 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  46.94 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  42.16 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  46.81 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  57.75 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  47.37 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  46.81 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  41.96 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  41.96 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  43.24 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  48.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  48.75 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  44.04 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  44.04 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  47.56 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  46.32 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  47.56 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  41.24 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  55.56 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  45.68 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  45.37 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  45.37 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  43.16 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  47.83 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  47.83 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  40.86 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  47.3 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  40 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  42.31 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  40.7 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  41.56 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  37.97 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  37.11 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  38.14 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  37.35 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  34.41 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  36.56 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  43.53 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  40 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  39.24 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  33.33 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  42.19 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  31.43 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  39.44 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  30.39 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  40.32 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  29.17 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  43.24 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  34.57 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  30.85 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  32.91 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  42.67 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>