80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0739 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  226  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  54.13 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  51.38 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  57.43 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  54.72 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  53.15 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  54.95 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  54.95 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  51.85 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  54.95 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  54.95 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  47.62 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  46.08 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  46.73 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  49.48 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  45.54 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  47.92 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  47.92 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  46.67 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  48.45 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  49.48 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  40.74 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  51.55 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  49.06 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  46.81 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  47.17 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  50 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  47 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  45.74 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  47.87 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  46.81 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  56.76 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  51.85 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  51.85 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  50.62 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  51.85 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  56.76 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  50.62 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  41.49 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  44.68 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  54.05 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  43.62 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  45.57 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  37.14 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  39.05 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  41.9 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  47.44 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  44.16 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  39.05 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  46.88 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  39.05 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  45.65 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  40.22 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  48.44 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  34.51 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  31.86 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  32.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  31.58 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  40.58 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  39.73 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  34.57 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  38.36 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  42.42 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  42.42 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  42.42 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  35.71 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2326  baseplate protein  30.61 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  40.32 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  30.14 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  35.09 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  31.4 
 
 		 140 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  35.37 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  34.21 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  30.86 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  38.1 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>