70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2908 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  47.32 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  47.32 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  43.88 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  43.88 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  43.88 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  38.37 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  44.16 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  37.65 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  36.27 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  38.54 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  40 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  36.9 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  37.84 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  41.54 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  36.14 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.63 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  38.03 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  39.13 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  37.68 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  34.48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  36.62 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  36.47 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  37.88 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  35.71 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  36.49 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  31.18 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  34.67 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  33.8 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  33.68 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  31.25 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  35.14 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  32.22 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  38.36 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  31.25 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  38.03 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  36.47 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  34.72 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  36.62 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  32.47 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  35.14 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  35.21 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  28.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  35.21 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  25.23 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  32.89 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  34.94 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  33.72 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  37.84 
 
 		 115 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  34.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 116 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  32.74 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  32.35 
 
 		 117 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  29.21 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  29.03 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  31.68 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  34.72 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  37.84 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  29.21 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  36.92 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  40.68 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  28.21 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.21 
 
 		 147 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>