66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0924 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  67.69 
 
 
165 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  57.25 
 
 
139 aa  170  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  60.63 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  54.33 
 
 
135 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  50.74 
 
 
145 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  53.91 
 
 
142 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  50.78 
 
 
130 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  50.78 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  47.24 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  44.35 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  45.31 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  46.46 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  43.9 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  42.52 
 
 
131 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  42.64 
 
 
136 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  44 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  36 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  35.88 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.11 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  36.29 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  33.06 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  32.8 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  37.96 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  30.65 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  30.33 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  34.95 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  32.39 
 
 
311 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  31.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  31.69 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  31.69 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  35.58 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  24.06 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  37.65 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  32.41 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  37.14 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  37.68 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  36.23 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  34.78 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  36.23 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  32.53 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  34.78 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  31.73 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  31.07 
 
 
122 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  35.71 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  35.71 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  33.72 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  32.67 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  30.69 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  32.1 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  30.14 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  30.53 
 
 
116 aa  42  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  30.88 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  32.58 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  32.32 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  33.33 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
116 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
116 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>