62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3929 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 142 aa  293  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  46.21 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  45.19 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  47.69 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  45.52 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  45.45 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  45.74 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  45.45 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  43.97 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  43.26 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  43.2 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  46.09 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  42.36 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  40.44 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  40.8 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  39.84 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  40.94 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  36.8 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  43.2 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  37.4 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  39.23 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  36.17 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  39.39 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  37.1 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  39.2 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  36 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  36.43 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  33.81 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  33.81 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.31 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  29.52 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  27.27 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  32.31 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  32.18 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  31.08 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  28.74 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  26.44 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  33.85 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  26.32 
 
 		 116 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  31.65 
 
 		 127 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  32.31 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  29.91 
 
 		 116 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  34.07 
 
 		 123 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  31.25 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  29.23 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  29.76 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  27.73 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  34.29 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  27.12 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  35.23 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>