29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1139 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  67.21 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  56.69 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  45.19 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  41.58 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  38 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  39.05 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  36.89 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  50.94 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  30.48 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  29.52 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.74 
 
 		 311 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  34.74 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  34.74 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  37.8 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  31.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  28.16 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  31.51 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  33.02 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  32.95 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  29.29 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  29.41 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  42 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  24.64 
 
 		 148 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  35.29 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  36.54 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>