60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3607 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  53.44 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  47.69 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  47.29 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  45.67 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  47.29 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  46.77 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  45.9 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  45.74 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  45.53 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  45.53 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  46.56 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  45.74 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  40.91 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  42.64 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  46.46 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  43.41 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  39.53 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  41.73 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  40.91 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  42.19 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  37.12 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  35.94 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  39.26 
 
 		 305 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  39.26 
 
 		 305 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  37.82 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  39.26 
 
 		 311 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  44.33 
 
 		 166 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  35.71 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  31.62 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  29.5 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  36.11 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  46.67 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  35.05 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  31.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  32.35 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  32.35 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  36.49 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  37.18 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  31.82 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  29.51 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  38.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  32.5 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  22.94 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  34.18 
 
 		 115 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  26.79 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  35.59 
 
 		 108 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 127 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>