88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0668 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  54.96 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  54.96 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  51.82 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  47.83 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  44.27 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  45.52 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  44.6 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  44.52 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  42.45 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  44.36 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  43.9 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35.94 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  36.22 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  33.87 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  31.5 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  34.11 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  36.43 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  35.66 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  34.92 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  31.75 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  32.8 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  31.62 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  29.84 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  32.06 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  30.65 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  33.86 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  30.47 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  32.46 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  29.51 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  30.61 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  27.07 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  27.07 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  27.07 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  30.68 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  30.95 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  31.71 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  29.27 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  24.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  27.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  35.71 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  35.94 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  35.94 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  32.99 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  32.05 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  28.38 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  30.26 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  28.43 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  28.43 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  28.43 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  27.63 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  31.87 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  28.95 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  28.21 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  28.44 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  27.55 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  28.74 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  27.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  28.24 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  30.14 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  31.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  30.14 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  32.47 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  28.57 
 
 		 116 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  32.47 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  28.41 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  32.93 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3592  GPW/gp25 family protein  31.73 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  29.23 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  29.23 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  31.51 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  27.4 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  31.03 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  33.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>