95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1726 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  55.56 
 
 
132 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  41.13 
 
 
135 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  38.4 
 
 
139 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  37.9 
 
 
145 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  40.31 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  42.19 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  36.72 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 
142 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  40.31 
 
 
133 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  36.29 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  37.4 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  40 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  36.59 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  38.4 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  38.1 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  37.7 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  37.68 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  33.06 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  34.62 
 
 
140 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  36.72 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  31.78 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  37.6 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  32.52 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  35.29 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  35.29 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  30.47 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  34.13 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  29.84 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  33.65 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  29.29 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  44.59 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  39.74 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  28.8 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  40 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  28.8 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  36.71 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  29.52 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  34.12 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  35.14 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  34.62 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  34.62 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  29.32 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  34.62 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  31 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  32.74 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  35.51 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  34.57 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  39.24 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  32.99 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  40.62 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  29.47 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  29.09 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  38.16 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  38.57 
 
 
116 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  44.44 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  28.87 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  40 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  38.81 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  33.64 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  32.56 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  38.57 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  38.24 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  38.24 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  34.33 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  35.16 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  37.68 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  41.79 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  35.9 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  32.86 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  28.16 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  28.3 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  28.44 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  26.8 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  30 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  32.86 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  36.92 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  31.94 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  36.51 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  37.5 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  36.51 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  32.74 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  27.85 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  24.3 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>