82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4378 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  72.41 
 
 		 116 aa  174  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  62.61 
 
 		 115 aa  150  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  61.74 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  62.61 
 
 		 114 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  62.28 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  60 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  60.36 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  58.41 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  61.47 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  60.55 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  57.66 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  58.72 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  58.72 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  58.72 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  58.72 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  64.94 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  55.67 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  64.1 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  62.34 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  50 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  47.27 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  47.57 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  44.74 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  45.45 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  52.94 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  47.37 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  45.71 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  52.75 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  52.75 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  49.09 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  39.81 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  43.43 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  41.75 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  39.6 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  41.75 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  39.6 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  45.74 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  49.37 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  37.74 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  44.16 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  41.77 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  37.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  42.31 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  42.31 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  36.89 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  36.89 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  36.89 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  36.89 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  46.77 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  42.55 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  38.96 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  36.9 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  32.63 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  35.06 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  37.97 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  31.71 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  35 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  35.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  33.33 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  33.33 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  38.03 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  28.12 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  32.1 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  34.18 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 		 130 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  27.72 
 
 		 115 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  32.88 
 
 		 132 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  30.67 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  29.89 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  31.34 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  33.68 
 
 		 151 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>