61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0588 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  76.43 
 
 		 139 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  39.34 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  40.16 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  36.29 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  41.18 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  42.31 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  41.56 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2326  baseplate protein  34.85 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  34.51 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  37.78 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  36.71 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  35.35 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  34.04 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  32.04 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  35.8 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  43.9 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  33.77 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  41.03 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  33.77 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  35.06 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  34.62 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  34.62 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  32.65 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  32.05 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  34.62 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  33.75 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0684  hypothetical protein  32.48 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  34.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  35.06 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  34.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  31.71 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  36 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  32.91 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  28.57 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  30.12 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  28.92 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  34.67 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  31.33 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  32.05 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  28.21 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  34.62 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  35.45 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  29.13 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  31.58 
 
 		 117 aa  42  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  30.38 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  33.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>