79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2297 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 99 aa  204  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  98.99 
 
 		 99 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  95.96 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  89.66 
 
 		 117 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  64.63 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  71.05 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  71.05 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  71.05 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  65.38 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  69.74 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  64.94 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  63.41 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  61.25 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  68.42 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  64.1 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  65.79 
 
 		 119 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  62.82 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  62.82 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  56.25 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  58.62 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  55.43 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  58.9 
 
 		 116 aa  95.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  58.9 
 
 		 116 aa  95.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  55.26 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  56 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  59.72 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  59.46 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  48.1 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  59.72 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  55.41 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  56.76 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  51.19 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  47.56 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  48.61 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  49.37 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  49.33 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  45.33 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  42.11 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  51.35 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  51.35 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  51.35 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  51.35 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  48.84 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  48.65 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  47.3 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  39.53 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  42.67 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  39.58 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  44.44 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  50 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  41.89 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  49.15 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  44.59 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  42.19 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  33.78 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  35.94 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  35.62 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35.94 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  41.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  37.8 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  35.59 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  37.7 
 
 		 305 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  37.7 
 
 		 305 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  37.7 
 
 		 311 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  40 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  34.67 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  36.51 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  31.94 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  36.62 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1140  hypothetical protein  34.57 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.12512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  27.85 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  40.62 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  32.79 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  29.21 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  39.06 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>