83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2853 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  89.92 
 
 
119 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  84.87 
 
 
119 aa  209  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  84.03 
 
 
119 aa  206  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  84.03 
 
 
119 aa  206  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  82.35 
 
 
119 aa  204  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  61.68 
 
 
114 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  60 
 
 
116 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  61.47 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  59.63 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  60.55 
 
 
116 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  58.04 
 
 
117 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  57.41 
 
 
115 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  57.41 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  57.8 
 
 
116 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  54.13 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  68.42 
 
 
99 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  68.42 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  65.79 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  48.28 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  44.25 
 
 
125 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  48.11 
 
 
112 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  51.4 
 
 
117 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  51.55 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  49.47 
 
 
122 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  48.98 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  47.32 
 
 
116 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  46.08 
 
 
108 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  48.48 
 
 
123 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  55.56 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  47.31 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  46.81 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  47.71 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  47.71 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  44.76 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  44.21 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  45.1 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  41.49 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  47.5 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  43.16 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  44.68 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  38.89 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  40.22 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  43.75 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  40.43 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  41.3 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  45.57 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  42.55 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  42.55 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  42.55 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  42.55 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  35.14 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  40.43 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  34.21 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  34.57 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  39.13 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  36.49 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  32.05 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  29.41 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  32.05 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  31.33 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  33.68 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  35.53 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  30.12 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  31.43 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  32.93 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  29.41 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  31.18 
 
 
115 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  35.14 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  26.25 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  28.4 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  30.23 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  28.4 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  26.09 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  34.33 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  28.4 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  34.33 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  31.18 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  32.84 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  29.76 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  35.82 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>