61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2460 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  47.62 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  47.52 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  46.15 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  42.96 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  44 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  41.3 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  42.36 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  38.36 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  43.26 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  41.13 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  36.81 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  34.27 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  38.73 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  33.09 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  31.58 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  32.87 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  32.09 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  31.88 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  30.66 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  32.09 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  31.65 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  30.94 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  27.21 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  29.2 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  30.3 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  31.65 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  29.32 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  29.32 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  29.29 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  28.57 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  24.82 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  24.06 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  31.43 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  31.43 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  31.43 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  36.47 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  27.36 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  34.52 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  27.78 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  30.49 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  30.23 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  27.72 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  33.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  32.56 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  32.56 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  32.56 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  36 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  24.56 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  34.12 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  31.08 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  35.48 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  31.76 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  32.95 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  28.87 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  29.76 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  28.24 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  32.56 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>