49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1679 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  93.88 
 
 		 147 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  54.96 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  53.08 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  48.87 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  50.77 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  49.62 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  43.61 
 
 		 148 aa  119  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  43.75 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  43.97 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  44.8 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  41.13 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  44.17 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  40.46 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  38.28 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  38.76 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  37.21 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  39.2 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  37.88 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  39.2 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  36.76 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  37.21 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  33.83 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  34.11 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  32.28 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  34.92 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  33.58 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  33.58 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  33.58 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  34.4 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  28.8 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  34.34 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  34.18 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  32.94 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  26.19 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  34.43 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  26.32 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  33.8 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  31.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  33.72 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  37.68 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  30.77 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>