72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3824 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 142 aa  284  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  55.64 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  61.9 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  53.28 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  53.91 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  56.15 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  52.31 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  48.84 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  47.29 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  50.39 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  45.59 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  45.67 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  45.31 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  47.15 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  38.21 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  43.2 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  38.17 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  38.21 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  35.16 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  39.2 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  49.48 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  37.31 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  35.97 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  35.48 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  34.92 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  34.13 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.92 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  34.43 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  34.62 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  36.15 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  39.6 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  31.09 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  38.74 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  44.29 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  42.86 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  41.43 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  40.58 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  38.37 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  36.19 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  32.98 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  32.98 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  31.78 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  38.55 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  31.25 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  41.43 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  38.57 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  34.15 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  26.88 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  32.39 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  32.39 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  30.23 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  29.21 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  39.39 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  33.82 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  32.88 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  33.33 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>