35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4539 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  65.79 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  65.79 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  43.88 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  38.24 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  36.67 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  36.26 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  37.5 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  35.37 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  35.53 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  28.43 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  42.42 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  38.24 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  33.8 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  36.76 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  36.59 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  35.37 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  39.39 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  35.87 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  37.31 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  32.56 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  33.8 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  36.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  34.78 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  38.55 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  40.68 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  39.13 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  33.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  33.82 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  39.47 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>