54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0674 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
139 aa  283  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  53.68 
 
 
145 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  52.71 
 
 
141 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  47.76 
 
 
136 aa  140  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  47.83 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  45.19 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  42.54 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  42.11 
 
 
140 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  43.75 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  45.31 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  42.97 
 
 
148 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  40.15 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  43.28 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  40.46 
 
 
132 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  40.48 
 
 
131 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 
131 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  39.23 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  36.8 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  37.12 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  39.52 
 
 
135 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  34.68 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  36.8 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  36.29 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  36 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  35.77 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  33.86 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  33.86 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  35.66 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  34.35 
 
 
305 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  34.35 
 
 
305 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.35 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  29.84 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  33.06 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  32.97 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  36.17 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  36.17 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  28.12 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  30.12 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  28.28 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  31.88 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  27.14 
 
 
108 aa  42  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  29.73 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  31.88 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  31.65 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  27.93 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  24.74 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  24.74 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  30.43 
 
 
108 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>