66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1951 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
131 aa  266  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  48.03 
 
 
133 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  46.15 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  45.67 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  45.67 
 
 
145 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  43.31 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  44.09 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  42.74 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  45.97 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  45.9 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  42.52 
 
 
146 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  45.24 
 
 
139 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  45.6 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  43.85 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  42.52 
 
 
136 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  44.35 
 
 
165 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  43.09 
 
 
140 aa  103  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  40.62 
 
 
140 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  43.2 
 
 
142 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 
139 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  42.28 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  42.06 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  39.39 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  37.88 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  41.82 
 
 
145 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  40 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  38.64 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  36.22 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  33.08 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  34.92 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  34.56 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  32.06 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  31.88 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  35.34 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  35.34 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  35.34 
 
 
311 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  36.89 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  29.84 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  29.46 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  31.9 
 
 
125 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  36.89 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  36.99 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  36.99 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  30.91 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  34.12 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  28.44 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  35.21 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  32.65 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  31.37 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  41.67 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  36 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  32.41 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  35.06 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  27.08 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  33.33 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  37.14 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  32.5 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  30.34 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  37.5 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  36.62 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  35.37 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  29.49 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  27.37 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  35.71 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>