27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0617 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  86.62 
 
 		 144 aa  260  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  51.13 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  42.96 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  44.53 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  44.53 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  44.53 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  44.53 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.01 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  33.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  29.81 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  31.43 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  37.68 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  27.69 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  26.92 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  29.49 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  31.18 
 
 		 141 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  27.83 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>