41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3643 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  52.63 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  51.13 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  42.96 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  48.85 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  48.85 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  48.09 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  43.85 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.23 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  30.19 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  29.52 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  27.62 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  28.03 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  27.21 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  26.47 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  30.11 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  28.07 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  32.53 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  37.11 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  24.19 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  24.53 
 
 		 143 aa  43.5  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  24.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  24.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  24.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  36.17 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  32 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  22.41 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  31 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>