21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0020 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  26.15 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  24.8 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.25 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  23.97 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.72 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  22.69 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  30.68 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>