28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2584 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  99.33 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  99.33 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  90.85 
 
 		 149 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  74.66 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  59.72 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  59.12 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  46.27 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  48.09 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  32.74 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  30.97 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  37.11 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  30.17 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  26.09 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>