38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3134 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  59.56 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  54.74 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  59.12 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  59.12 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  59.12 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  59.12 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  42.96 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  44.03 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  43.85 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  29.2 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  30.91 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  29.35 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  36.23 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  29.36 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  29.75 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  30.09 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  34.31 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  36.14 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  27.37 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  30.49 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.41 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  27.4 
 
 		 136 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>