35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3242 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  60.42 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  60.42 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  59.72 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  54.48 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  58.87 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  54.74 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  41.73 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  41.01 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.23 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  37.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  34.55 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  30.85 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  31.65 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  35.24 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  30.84 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  27.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  27.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  27.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3047  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.18 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.216623  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>