20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0158 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  32.79 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.71 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.76 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  34.94 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  36.14 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.13 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  30.11 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  32.61 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  29.46 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  29.46 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.68 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>