34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3226 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 136 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  88.97 
 
 		 136 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  88.24 
 
 		 136 aa  247  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  83.09 
 
 		 136 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  34.85 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.52 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.53 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.01 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.24 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  31.54 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.27 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  33.02 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  32.71 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  32.71 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  28.12 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  31.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.88 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  27.88 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  27.19 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  28.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  27.34 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  27.34 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  35.62 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  22.95 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>