75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1511 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
131 aa  267  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  47.2 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  50.4 
 
 
133 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  46.77 
 
 
136 aa  120  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  42.74 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  43.09 
 
 
132 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  44 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  42.28 
 
 
130 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  39.84 
 
 
130 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  39.52 
 
 
140 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  39.34 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  40.8 
 
 
165 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  40.16 
 
 
135 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  40 
 
 
135 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  40.65 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  37.01 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  36.59 
 
 
140 aa  95.9  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  36.8 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  38.21 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  39.85 
 
 
305 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  39.85 
 
 
305 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  38.21 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  39.55 
 
 
311 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  39.2 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  38.4 
 
 
147 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  38.4 
 
 
133 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  34.68 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  34.96 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  37.4 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  38.35 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  36.43 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  34.48 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  38.71 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  37.9 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  34.15 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  30.66 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  44.93 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  35.2 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  33.67 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  28.7 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  37.33 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  29.13 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  27.62 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  32 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  38.24 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  32 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  40.91 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  33.73 
 
 
115 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  36.23 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  36 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  30.1 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  37.68 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  34.85 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  40 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  26.8 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  33.33 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  28.57 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  23.93 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  32.31 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  28.41 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  40 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  35.38 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  30.86 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  32.79 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  36.51 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  32.79 
 
 
99 aa  40.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  36.23 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  25.53 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  23.96 
 
 
116 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0831358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>