87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1873 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
129 aa  256  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  40.71 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  38.46 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  35.34 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  45.24 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  39.6 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  38.95 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  36.47 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  35.58 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  38.61 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  37.89 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  33.65 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  33.65 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  40 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.62 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  39.56 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  46.67 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  36.78 
 
 
311 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  41.05 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  35.63 
 
 
305 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  35.63 
 
 
305 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  35.37 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  33.67 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  37.5 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  38.03 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  36.54 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  38.03 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  38.03 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  32.14 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  38.81 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  29.46 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  37.66 
 
 
115 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  37.84 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  28.12 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  33.87 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  38.71 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  33.71 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  30.95 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  30.43 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  37.1 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  35.48 
 
 
115 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  35.48 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  35.48 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  35.48 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  35.48 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  33.87 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  35.71 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  32.26 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  32.94 
 
 
147 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 
116 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  30.49 
 
 
116 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  39.44 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  29.09 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  36.23 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  26.04 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.67 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  30.77 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  34.38 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  30.12 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  35.59 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  35.59 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  29.58 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  27.38 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  29.63 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  30.65 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  38.1 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  32.2 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  32.82 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  35.37 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  35.71 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  24.14 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>