78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2890 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  55.74 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  41.75 
 
 		 130 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  42.72 
 
 		 130 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  44.33 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  43.56 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  41.9 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  36.69 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  44.44 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  36.72 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  36.19 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  34.95 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  44.93 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  36.89 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  36.89 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  36.52 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  37.37 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  34.95 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  35.58 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  43.42 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  38.61 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  43.42 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  43.42 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  38.38 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  33.65 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  33.96 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  33.06 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  29.9 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  41.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  37.37 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  30.61 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  37.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  34.34 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.34 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  39.19 
 
 		 130 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  50.94 
 
 		 124 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  27.88 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  32.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  39.44 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  36.99 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  36.62 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  33.71 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  39.44 
 
 		 108 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  41.94 
 
 		 116 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  40.85 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  28.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  37.8 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  37.8 
 
 		 99 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  27.42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  42.03 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  38.1 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  41.03 
 
 		 109 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  42.19 
 
 		 112 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  32.93 
 
 		 119 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  41.51 
 
 		 120 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  39.39 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  34.88 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  40.32 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  32.39 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  32.39 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  32.39 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  30.95 
 
 		 119 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  38.71 
 
 		 115 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  32.47 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  33.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  35.37 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  36.51 
 
 		 123 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  36.07 
 
 		 119 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>