23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0684 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  31.45 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  31.82 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  41.56 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  32.43 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  31.68 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  33.93 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  40.26 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  38.96 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  31.37 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  32.48 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  35.9 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  34.55 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  29.7 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  29.7 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2326  baseplate protein  25.23 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  33.33 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  35.06 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  27 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  29.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  29.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  30.84 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  24.75 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>