22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2326 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2326  baseplate protein  100 
 
 		 131 aa  266  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  34.55 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  32.11 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  29.13 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  37.74 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  30.38 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  30.38 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  28.12 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  36.99 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0684  hypothetical protein  25.23 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  34.62 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  28.87 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  31.96 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  31.46 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  30.61 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  27.5 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  26.47 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  29.79 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>