More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3134 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013207  Aaci_3134  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0590  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 		 594 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 		 594 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.88 
 
 		 612 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.98 
 
 		 612 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2991  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 		 615 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2357  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 		 613 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2971  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 		 613 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 		 612 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.77 
 
 		 676 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 613 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.88 
 
 		 753 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 613 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.73 
 
 		 616 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 		 633 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  29.91 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  29.91 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  32.61 
 
 		 419 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.02 
 
 		 616 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.38 
 
 		 464 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 		 610 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.38 
 
 		 464 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 		 587 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  34.38 
 
 		 515 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  34.38 
 
 		 428 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  34.38 
 
 		 429 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  34.07 
 
 		 428 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.36 
 
 		 402 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  27.93 
 
 		 584 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.8 
 
 		 606 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  32.17 
 
 		 419 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  34.07 
 
 		 428 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.65 
 
 		 590 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 584 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  33.94 
 
 		 454 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 		 428 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 		 428 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 		 428 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 584 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.46 
 
 		 585 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 583 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 583 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.19 
 
 		 585 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.19 
 
 		 585 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.19 
 
 		 585 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  31.7 
 
 		 423 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.06 
 
 		 580 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  29.28 
 
 		 387 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  31.74 
 
 		 447 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  30.26 
 
 		 475 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  30.73 
 
 		 437 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.68 
 
 		 572 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  34.25 
 
 		 456 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  28.38 
 
 		 284 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.78 
 
 		 599 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.55 
 
 		 632 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  32.3 
 
 		 429 aa  85.9  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 422 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 		 777 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4968  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  32.3 
 
 		 447 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  28.7 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.36 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 		 806 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  29.82 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0836  diguanylate phosphodiesterase  26.91 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.861332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.58 
 
 		 581 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.8 
 
 		 797 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 		 786 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.45 
 
 		 790 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  28.76 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  29.18 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  28.76 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  27.27 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4836  putative diguanylate phosphodiesterase  28.9 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252765  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  30.8 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  28.25 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  30.49 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.99 
 
 		 611 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0846  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.51 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  30.36 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  30.22 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1993  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.6 
 
 		 1034 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.717773  normal  0.933886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  26.43 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  29.73 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2566  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.61 
 
 		 649 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0181477 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  27.95 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  29.28 
 
 		 485 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  28.7 
 
 		 403 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>