More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2160 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  99.59 
 
 
484 aa  959    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
484 aa  963    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  72.06 
 
 
507 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  72.56 
 
 
498 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  53.37 
 
 
426 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  51.19 
 
 
436 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.92 
 
 
468 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  51.19 
 
 
436 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  50.27 
 
 
439 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  51.97 
 
 
438 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  45.99 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  48.53 
 
 
445 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.1 
 
 
438 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.1 
 
 
438 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  48.78 
 
 
439 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.84 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  53.19 
 
 
438 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.14 
 
 
439 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  50.86 
 
 
441 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.52 
 
 
439 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.98 
 
 
482 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.98 
 
 
482 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  49.73 
 
 
432 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.26 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.26 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 
440 aa  336  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.73 
 
 
462 aa  329  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.55 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  49.11 
 
 
415 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
483 aa  319  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 
481 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  45.17 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.28 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  45.62 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  45.32 
 
 
456 aa  312  7.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.47 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  47.04 
 
 
478 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  46.67 
 
 
458 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  46.51 
 
 
442 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  45.09 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  47.83 
 
 
530 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.44 
 
 
443 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  47.54 
 
 
521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  45.87 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 
515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 
515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 
515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  48.41 
 
 
515 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  45.7 
 
 
479 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  47.25 
 
 
515 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  48.49 
 
 
456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  45.62 
 
 
471 aa  306  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 
524 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 
524 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 
524 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 
524 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  46.96 
 
 
524 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.96 
 
 
530 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  46.96 
 
 
530 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  45.43 
 
 
479 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.83 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  45.19 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  43.92 
 
 
526 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 
522 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 
513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  43.46 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.05 
 
 
457 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  43.15 
 
 
443 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.51 
 
 
480 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  43.4 
 
 
444 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 
461 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  46.53 
 
 
478 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 
458 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 
440 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 
440 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 
550 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.64 
 
 
440 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 
538 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  43.75 
 
 
440 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  43.58 
 
 
452 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  43.55 
 
 
468 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  40.91 
 
 
451 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 
444 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.48 
 
 
444 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 
456 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 
451 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  43.55 
 
 
481 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  42.71 
 
 
449 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.09 
 
 
423 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  44.11 
 
 
447 aa  293  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 
440 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 
441 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>