More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0297 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  50.68 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  33.79 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 309 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 320 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 340 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 340 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 326 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  31.17 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 349 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  27.59 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.87 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 347 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>