More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0109 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  50.26 
 
 
709 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  45.58 
 
 
744 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  50.91 
 
 
690 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  50.32 
 
 
696 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  52.99 
 
 
706 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  46.48 
 
 
739 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  51.95 
 
 
719 aa  714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  49.17 
 
 
726 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  52.4 
 
 
698 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  52.99 
 
 
706 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  51.29 
 
 
712 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  100 
 
 
782 aa  1539    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  53.06 
 
 
706 aa  719    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  51.89 
 
 
688 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  48.76 
 
 
695 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  51.03 
 
 
706 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  52.53 
 
 
698 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  46.81 
 
 
703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  38.39 
 
 
818 aa  578  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  40.14 
 
 
838 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  44.51 
 
 
748 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  44.24 
 
 
686 aa  554  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  45.26 
 
 
726 aa  545  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  42.93 
 
 
685 aa  545  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.49 
 
 
688 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.24 
 
 
682 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.85 
 
 
699 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  36.4 
 
 
705 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  36.25 
 
 
721 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  36.41 
 
 
686 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.62 
 
 
711 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  35.15 
 
 
686 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  38.38 
 
 
678 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.25 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  40.31 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  38.05 
 
 
708 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.51 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  38.62 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  41.97 
 
 
682 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  38.6 
 
 
703 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  38.4 
 
 
710 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.79 
 
 
685 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  37.69 
 
 
683 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.61 
 
 
680 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  41.12 
 
 
680 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  37.92 
 
 
701 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  35.46 
 
 
696 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  35.26 
 
 
671 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  36.46 
 
 
696 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  38.14 
 
 
705 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  38.36 
 
 
713 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  40.08 
 
 
684 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  37.77 
 
 
717 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  36.96 
 
 
683 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  40.5 
 
 
678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.29 
 
 
683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  40.05 
 
 
696 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  36.49 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  37.44 
 
 
697 aa  452  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  39.08 
 
 
690 aa  452  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  36.49 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  36.49 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  37.07 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  36.64 
 
 
702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  37.82 
 
 
700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  39.97 
 
 
683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  37.8 
 
 
701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  34.75 
 
 
719 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  36.68 
 
 
709 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  34.51 
 
 
697 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  36.64 
 
 
702 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  36.42 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  36.55 
 
 
677 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  34.51 
 
 
725 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  36.42 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  36.42 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  36.42 
 
 
711 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  37.55 
 
 
683 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  36.42 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.06 
 
 
698 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  36.92 
 
 
710 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  36.25 
 
 
702 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  38.92 
 
 
711 aa  436  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  36.05 
 
 
711 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  33.8 
 
 
704 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  36.2 
 
 
702 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  36.08 
 
 
700 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  36.33 
 
 
702 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  34.77 
 
 
697 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  38.13 
 
 
703 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  35.03 
 
 
686 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  34.55 
 
 
686 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  34.55 
 
 
686 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  34.93 
 
 
729 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  34.9 
 
 
686 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  35.41 
 
 
711 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  33.72 
 
 
722 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  34.77 
 
 
686 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  35.41 
 
 
711 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  34.77 
 
 
686 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>