More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4829 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  79.9 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  78.47 
 
 		 209 aa  323  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.41 
 
 		 216 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  74.41 
 
 		 216 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 208 aa  296  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.27 
 
 		 208 aa  291  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  72.33 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  58.59 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.76 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  48.77 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.61 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 202 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.55 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  48.22 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.07 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  48.04 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  46.86 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  43.35 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  45.81 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.35 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.35 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  42.65 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  41.18 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  41.24 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  42.86 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  44.72 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  44.72 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  42.16 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.39 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  41.75 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>