More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2930 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  41 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  38.49 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  39.92 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  34.75 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  32.77 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.58 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.05 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2412  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.05 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 259 aa  72  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.78 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.06 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  29.39 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  28.96 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  25.51 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  28.75 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.65 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.18 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  28.23 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  25.56 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  24.24 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  26.36 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  27.03 
 
 		 293 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  26.81 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  23.73 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  27.43 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  27.03 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2360  regulatory proteins, IclR  27.75 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>