More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0993 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0993  ABC transporter related  100 
 
 
363 aa  718    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5873  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.24 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 
359 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
346 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.58 
 
 
345 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.6 
 
 
369 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  49.19 
 
 
343 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.79 
 
 
343 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.39 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2969  ABC transporter related  49.59 
 
 
418 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.979711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
376 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  39.5 
 
 
350 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  40.9 
 
 
366 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
376 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
378 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  41.62 
 
 
364 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  43.69 
 
 
354 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  38.69 
 
 
386 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  42.59 
 
 
343 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3621  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.24 
 
 
340 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.247343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  44.68 
 
 
527 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49 
 
 
382 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 
339 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.7 
 
 
380 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.99 
 
 
359 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.83 
 
 
342 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.08 
 
 
353 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.66 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.01 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.8 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.13 
 
 
367 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.37 
 
 
348 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  41.69 
 
 
368 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.11 
 
 
373 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
382 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.2 
 
 
338 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.23 
 
 
360 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.33 
 
 
356 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 
377 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 
423 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
375 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
375 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.33 
 
 
354 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
355 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  41.36 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.74 
 
 
373 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
367 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
393 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.61 
 
 
358 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
388 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  35.15 
 
 
367 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  47.37 
 
 
360 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 
388 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
388 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  41.18 
 
 
381 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  36.83 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2426  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.444349  normal  0.105607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  47.37 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  47.37 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.58 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.62 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.86 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.96 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  48.15 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.8 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 
373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.94 
 
 
372 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  44.68 
 
 
350 aa  220  3e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  42.14 
 
 
352 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  46.96 
 
 
360 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  46.96 
 
 
360 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1768  ABC transporter related  47.88 
 
 
361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.8 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.63 
 
 
367 aa  219  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.44 
 
 
352 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
363 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.75 
 
 
342 aa  219  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  46.96 
 
 
363 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.37 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  49.38 
 
 
359 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  41.41 
 
 
356 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.45 
 
 
399 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 
364 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.05 
 
 
355 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 
349 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.49 
 
 
363 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  46.53 
 
 
387 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 
370 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>