More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1768 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1768  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  736    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2969  ABC transporter related  60.93 
 
 
418 aa  454  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.979711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3636  ABC transporter related  55.96 
 
 
369 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3223  ABC transporter related  58.17 
 
 
384 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1945  ABC transporter related  58.94 
 
 
371 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0346  ABC transporter related  56.29 
 
 
364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3887  ABC transporter related  55.59 
 
 
368 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4307  ABC transporter related  46.22 
 
 
360 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0457918  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.56 
 
 
377 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.44 
 
 
377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.21 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
382 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
359 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  50.31 
 
 
355 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
423 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.01 
 
 
381 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
363 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 
373 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 
372 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  43.85 
 
 
387 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 
447 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.95 
 
 
382 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.14 
 
 
365 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.78 
 
 
360 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 
371 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
372 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.35 
 
 
387 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
366 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 
378 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 
372 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
395 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.68 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 
366 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.2 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.5 
 
 
373 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 
380 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 
372 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
353 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  52.13 
 
 
363 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 
374 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.48 
 
 
360 aa  279  7e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 
346 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  53.33 
 
 
527 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 
352 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  44.84 
 
 
350 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  59 
 
 
343 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  51.06 
 
 
359 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
343 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  44.32 
 
 
381 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
372 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
380 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 
381 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.3 
 
 
377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  55.92 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  45.67 
 
 
364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.16 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 
358 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 
368 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.12 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3621  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.27 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.247343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.85 
 
 
363 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  45.99 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
363 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
400 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
365 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.98 
 
 
370 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 
356 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2815  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 
370 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 
372 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
377 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 
367 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
377 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
377 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.71 
 
 
382 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  43.26 
 
 
382 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 
338 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 
357 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.33 
 
 
337 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.94 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 
354 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 
376 aa  269  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.76 
 
 
356 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.44 
 
 
359 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
377 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 
366 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  42.29 
 
 
372 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.45 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2426  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.72 
 
 
382 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.444349  normal  0.105607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  45.21 
 
 
343 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>